Филогенетически дрожжи связаны как с сумчатыми, так и с базидиальными грибами. Размеры одиночных дрожжевых клеток лежат в пределах 1—10 мкм. При образовании мицелия или вытянутых клеток псевдомицелня длина их может достигать 50 мкм, в то время как ширина не превышает 10 мкм. Форма дрожжевой клетки зависит от способа вегетативного размножения. Оно происходит путем почкования, деления и почкующегося деления. При почковании возникают круглые, яйцевидные или овальные клетки. Это наиболее характерный и широко распространенный у дрожжей способ вегетативного размножения. Деление у дрожжей встречается реже, чем почкование. Клетки после деления могут оставаться одиночными или образовывать мицелий, который иногда распадается на артроспоры. Для рода кандида характерно образование ложного мицелия с бластоспорами и бластоконидиями, Это результат почкования без отделения клеток.

Дрожжи могут существовать в гаплоидной и диплоидной фазах. Смена ядерных фаз рассматривается как чередование поколений у дрожжей. Оно связано с oбразованием половых спор и может происходить по аскомицетному или базидиомицетному типу.